杨涟，从朱常洛驾崩到朱由校登基，可谓尽心尽职，他为了辅佐太子顺利登基，呕心沥血，几乎是夜夜不寝。
史书上称他在六天内“涟须发尽白，帝亦数称忠臣”。
朱由校继位后，杨涟升任兵科都给事中。
这时，御史冯三元等极力诋毁熊廷弼，杨涟公正疏陈此事。
不久后，他弹劾兵部尚书黄嘉善八大罪，黄嘉善遭罢免。
这时的杨涟，应当说是得到重用的。
朱由校的登基，东林党可谓居功至伟，而杨涟又是东林党中出力最多的人。然而，权力最后落在了魏忠贤和客氏的手中。
这一切，只因为，朱由校年纪太小，所信任的人是保姆和身边的太监！
魏忠贤和客氏相勾结，在宫中独揽大权，肆意为虐。
一些官吏纷纷投靠魏忠贤，结成“阉党”，打击和排斥东林党人。
杨涟看到这种情形，怀着满腔的悲愤，决心挺身而出，讨伐魏忠贤！
同年六月一日，杨涟将写好的奏疏藏在怀里，准备趁早朝时面奏朱由校，当场揭露魏忠贤。
不巧的是，当日免朝，杨涟“恐再宿机泄”，只好交会极门转呈朱由校。
杨涟在奏疏中列举了魏忠贤的二十四条罪状，揭露他迫害先帝旧臣、干预朝政，逼死后宫贤妃，操纵东厂滥施淫威等罪行，最后指出魏忠贤专权的恶果是“致掖廷之中，但知有忠贤，不知有陛下；都城之内，亦但知有忠贤，不知有陛下”。
他请求皇帝“大奋雷霆，集文武勋戚，敕刑部严讯，以正国法”。
杨涟的这个做法，勇则勇矣，智则不智，因为，他没把握好人性和形势。
这个人性，就是朱由校的人性。
朱由校如果是个有责任的皇帝，一看到杨涟的奏疏，马上去调查，知道魏忠贤是这样祸乱国家，一定会将他绳之以法，杨涟就一点事都没有，反而有大功。
可惜，朱由校不是一个称职的皇帝，在他的眼里，谁也比不上保姆客氏重要，简直就是他断奶不了的妈妈一样，一刻也离不开；至于魏忠贤，在他看来，更是大大的好人，忠厚的玩伴。
在朱由校这样的人性下，杨涟去搞魏忠贤，无异于是去送死！
杨涟此疏，虽然字字句句，如雷霆万钧，击中魏忠贤的要害，但是，真正能击败魏忠贤的，不是魏忠贤做了多少祸国殃民的事，也不是杨涟指出了魏忠贤多少坏事，而是，皇帝对魏忠贤的信不信任。如果皇帝对魏忠贤绝对的信任的话，那么，杨涟的话，就是纯属污蔑！
魏忠贤就是牢牢抓住这一点，所以，他慌忙跑到朱由校面前哭诉其冤，并利用朱由校不识字的缘故，削减罪状。
朱由校真假难辨，好坏不分，反而温言抚慰魏忠贤，“严旨切责”杨涟。
这样一来，魏忠贤没被杨涟搞死，反而要搞死杨涟了！
同年十月，魏忠贤开始反击，他矫旨责杨涟“大不敬”、“无人臣礼”，将杨涟革职为民。
魏忠贤挤走了杨涟，仍不肯善罢干休，必欲置之死地而后快。