在此情况下，土肥原贤二不得不除去张作霖。虽然张作霖明显不敌北伐军。但是，有这么一位有胆量和魄力与日本人翻脸的人在，日本基本上没有占据东北的可能。
所以，在一九二八年，六月四日，清晨五点二十三分，当张作霖乘坐的专列行至奉天皇姑屯火车站京奉线与南满线铁路交会处时，被土肥原贤二派人埋下的炸弹炸死。
如果张作霖不死，凭借其能和北伐军相抗衡的军事实力，和中国元首的名义，以及其对于中国局势的洞察力与天生的军事的才能。日后的中国，怕是还轮不到老蒋做主。
在炸死张作霖后，土肥原贤二谋取东北之心不死。而土肥原贤二做的第二件改变中国历史的事情，就是将溥仪成功带到东北。
当年，清朝灭亡后，前清的皇族仍旧被允许住在北京紫禁城。虽然没有了权柄，但是有清一朝所积攒的财富，全在北京城中。而且，溥仪还会获得每年四百万两白银的花销。日子过的优哉游哉。
直到后来，冯玉祥发动政变，占据北京，将溥仪赶出皇宫，溥仪的好日子才结束。不过，因为溥仪的身份特殊，所以，溥仪早已被土肥原贤二给盯上了。在溥仪被赶出紫禁城，走投无路时，土肥原贤二适时出现。
并亲自将溥仪接到天津日本使馆保护起来，这让溥仪感恩戴德。随后，板垣征四郎和石原莞尔两人策动了九一八事变。以少胜多，让日本人夺取了东北三省。张学良被赶出东北。
但是，在夺取东北后，板垣征四郎和石原莞尔也产生了争执，板垣征四郎主张借此契机，由日本人直接占领东北，将东北作为日本的领地进行统治。但是，石原莞尔却知道事情没有那么简单，坚决反对。
最终，还是土肥原贤二在关东军参谋长三宅光治的专门会议上，提出立一个由日本控制的、借助溥仪的名头进行统治的、脱离中国本土的“满蒙五族共和国”。最终，这个提议被日本人同意。
如果没有土肥原贤二，溥仪在群狼环伺下，怕是活不了几天。同样，没有土肥原贤二，伪满未必能建立起来。除了板垣征四郎和石原莞尔，土肥原贤二当时日本谋取中国东北的最大功臣。
在夺取东北后，日本人发现这种方法似乎可行。虽然以日本狭小的国土面积，单独面对中国的时候，无论如何都会显得渺小。但是，一旦将中国肢解成许多小部分。
那么，虽然相比日本的国土面积，仍旧显得略大，但是，由于日本对外开放较早，比较先进。所以，日本人将有十足的把握控制这些较小的区域。并且，日本人也明白，一旦将什么东西分割开，再想合并为一就难了。比如后世的韩国和朝鲜。
而且，将中国分割肢解后，一旦某一个地方发生了变故，日本就可集中兵力清缴，杀鸡给猴看。其他的区域自然会安稳下来。
所以，在日本人谋取东北后，下一个目标，就是策划华北自治。而主要的执行者，就是土肥原贤二。这是土肥原贤二改变中国历史的第三件事。
不过，土肥原贤二明显小瞧了中国人的智慧。此时，掌握华北的是北平的宋哲元、山西的阎锡山、济南的韩复榘和保定的商震。按照土肥原贤二的构想，只要这四个人能够达成利益共识，就能让华北自治，对抗老蒋。
不过，正如后世中国人对自己的历史进行评价时所说的那样——我们的历史太长，权谋太深，兵法太多，黑箱太大，内幕太厚，口舌太贪，眼光太杂，预计太险。
相比之下，天皇一脉延续了两千年，也没有臣子篡位的日本人，在利益交换这一道，简直就是幼儿园水平。所以，且不论这四个人如何构想，有没有自立一国的打算。土肥原贤二主动示好的表现，都是个败笔。
四个人谁也不做声，暗自衡量时事和土肥原贤二所出的价码。弄得土肥原贤二口干舌燥，一通许诺下，什么都没干成。
并且，老蒋也不是吃干饭的。土肥原贤二的小动作，全然被军统所知。纵然是老蒋在忙着“剿匪”，也不会不顾华北。这毕竟是中国人的起源之地。也是底线之一。
所以，老蒋知道土肥原贤二上蹿下跳的小动作之后，大骂两声娘希匹，派手下对这四人一通威逼利诱。老蒋这个现管的威逼利诱，显然比土肥原贤二的空口许诺要有用的多。四个人立马老实了许多。
土肥原贤二无奈之下，只能另选他法。扶植亲日派殷汝耕，于一九三五年十一月二十四日，余通州发布了所谓的“冀东防共自治政府”成立宣言。老蒋也没有料到土肥原贤二的这一招。
由于忙着剿匪，老蒋被逼无奈下，只能捏着鼻子认了。一九三五年，十二月十二日，老蒋被迫决定撤销行政院驻北平政务委员会和北平军分会，另设“冀察政务委员会”，辖区范围为河北、察哈尔两省和平津两市，任命宋哲元为“冀察政务委员会”委员长兼绥靖主任及河北省主席。
虽然，这个“冀察政务委员会”在建制上仍隶属老蒋管辖。但实际上，却是老蒋和日本人妥协的产物。虽然宋哲元对日本人虚与委蛇，土肥原贤二建立的所谓“华北自治”并没有太多的作用，只有一个空架子。
但是，毕竟，日本成功的在华北掺了一脚。如果日本人长久经营下去，未必不能化虚为实，实际掌控华北。将华北变成第二个伪满。
有此三件事在，土肥原贤二对于日本人而言是功臣，但是对于中国人而言，便是罪责难逃。土肥原贤二也知道自己的所作所为。所以，在远东国际军事法庭审判时，采取消极抵抗的态度。