若非李瑞鑫灵机一动的抽调了两门佛郎机炮加速了清军的崩溃，使其没有机会进行轮换的话，最终取得胜利的很可能是清军的督标营而非明军的南塘营。
之所以会出现这种问题主要还是因为他太过于迷信灵活的鸳鸯阵，却忽视了清军的应对。当下面对浙江清军，他的军阵缺乏的是厚重和密集，鸳鸯阵在局部密集方面很好，但是由于强调灵活的关系，厚重就显得不足了。
戚继光的办法是用车炮营来构建起临时的“城墙”，依仗火器来打散对手的军阵，再以骑兵和步兵突击，但是陈文面对的清军拥有大量的火炮，在坦克出现前，最好的办法还是依仗工事和士兵坚定的意志来进行防御、进攻，所以军阵就必须厚重起来，尤其是阵型的中部。而他则是在组建长枪阵杀手队的同时并没有发挥出其厚重的特长，还是过分依靠灵活的鸳鸯阵杀手队和火器队发起进攻，所以才会导致了现在两边都无法达成效果的尴尬处境。
既然如此，陈文打算将战兵营进行重新整编，所有长枪阵杀手队统一编入各营的第一局和第二局，鸳鸯阵杀手队则统一编入第三局和第四局。列阵时以厚重的长枪阵杀手队坐镇中军，灵活的鸳鸯阵杀手队扼守侧后，同时作为预备队存在，交战时按照情况通过变阵来进行调动，想来应该比现在有些不伦不类的锯齿阵要强。
阵法的修改，需要时间和训练进行磨合、适应，必须立刻开始改编。既然清军暂时避战，原本只对义乌营进行改编的陈文决定利用这段时间来分批次进行改编，其中各站兵营还要轮换回返金华府。除了补充外，那里还有更重要的事情需要战兵营的军官士卒们参与其间。
巡视了数日，陈文便回到了金华府城，而第一批轮换的部队则按照负责参谋们设计的时间表的安排进行。
没过数日，陈文便再度回到了府城，很是出乎金华府官吏士绅们的意料，不过听闻了清军暂时撤军的消息，一个个在稍微震惊了片刻后就连忙前来恭维陈文“虎威”震慑敌胆，陈锦摄于陈文之威连对战的勇气都没有。更有甚者还一口咬定别说是陈锦了，就算是金砺来了也是一样，不过却还是没人敢说满八旗军会害怕陈文，毕竟大伙都是文化人，拍马屁也要懂得分寸的说。
只不过，陈文对于这些恭维连给个耳朵的兴趣也没有。回到了府城，陈文便急匆匆的赶去军工司的作坊。
所谓军工司，就是原来的军器司，更遥远的大兰山营造司。陈文在平定叛乱后，军器司的文官小吏被清洗一空，工匠们迎来了新一批的领导，在得到陈文的许可后也把牌子换成了军工司，为的是和那些叛逆划清界限。
现在的军工司和曾经的军器司有着很大的区别，军器司改编自营造司，只是加入了一些俞国望带来的以及在金华府招募的工匠而已。相比之下，新的军工司中主要的行政官员换成了在叛乱中倾向于陈文的一些文官，同时再辅以几个识字的伤残军官进行监督，另外还挑选了几个手艺高明的工匠在各大作坊充当主管文官的副手，改变了原本的那种文官处于绝对领导地位的体制。
文官的权利受到限制，按照明朝的现实，遭受文官集团的抵制和反对几乎是必然会发生的。可是叛乱刚刚得到平息的当下，文官中职务最高的孙钰与陈文早有默契，下面的人面对提刑官们的屠刀也不敢跳出来触陈文的霉头，所以改革就这么无声无息的开始了。
当然，军工部门的问题不仅仅是体制，陈文在平定叛乱后通过和工匠以及士卒们的畅谈中也发现了一些其他的问题。
军工司的主要工作是制造军器，这是毋庸置疑的。但是现在军器司的工匠们还是老一套的手工打造，工匠们也都是匠户，若非大兰山的文官们在他们的老上司王翊、王江的监督中成长起来，还远没有堕落到明末工部衙门那般死猪不怕开水烫，估计陈文早就发飙了，也轮不到他们有机会附逆。
匠户制度是明朝自洪武朝就开始的，陈文利用募兵制和卫所制中间存在漏洞建立了金华镇和金华卫，将军户制度进行了有限的调整，但是直接改革匠户制度，他暂时还没有想好如何改良，所以改革的侧重点便在于提高工匠的工资待遇方面，这是曾经在现代做过销售的他所能够理解的。
提高待遇的办法并不是单纯的提高工资，除了奖励发明和悬赏以外，陈文决定按照计件工资的办法来刺激工匠们的劳动热情，毕竟抛去了应做的件数，做出来的越多就能获得越多奖金。当然，为了防止工匠们靠滥竽充数来提高生产效率，以后每件兵器上都必须要刻有主管官员、监督官员以及参与工匠们的代号，如果出现质量问题就要按照记录进行咎责。
陈文不知道明廷以前是不是这样做的，谁让他和大兰山的文官们都是野路子出身，不太了解工部衙门的细节。就连曾经作为明朝正规军亲兵的李瑞鑫也是如此，因为黄得功对于工部衙门生产出来的兵器、甲胄和其他武将一样不信任。但是既然大兰山明军以前没有，陈文觉得把好的制度拿出来总会有所裨益的。
当然，手工打造也存在一个问题，就是兵器虽然是制式的，但是或多或少都会有些出入。或是重量、长度，或是锋刃的弧度，亦或是别的什么，区别无处不在，但这就会影响到士卒的使用。尤其是火铳手，由于火铳的口径都会有些许差异，所以每个士兵都需要会使用工具来制造铅弹，大小不能合乎口径的还要进行打磨，火药的填装量也有所不同，这些不便都会耽误士兵们的休息时间，影响到训练和作战的效果。
可是达到真正意义上的标准化，他自知在以现在的技术还无法达成，只能先从标准化工匠们使用的测量工具和模具方面着手降低误差，想来应该会有效果。毕竟后世出土的秦朝标准化兵器的例子是存在的，技术达不到陈文暂时就只能来靠人工来弥补了。
其实在明末的中国，很多西方的科学技术都已经得到了士大夫阶级的肯定，尤其是和军事工业有关的科学技术，更是备受推崇。可是现在陈文想要引进，要不派人去澳门，要不就按照书籍中的记载一点点的复制，前者不太现实，而后者倒是可以再去派人寻找诸如《天工开物》的作者宋应星那般的本土科学家来进行技术攻关，但是不现实的问题同样存在，所以现在最好还是发布悬赏。
陈文相信，中国人的智慧并非那些蛮夷能够比拟的，草莽之中总会有些遗贤，而他要做的并非事必躬亲，只要把人才拣选出来即可。
离开了军工司，陈文又巡视了一番军需司，顾守礼在叛乱期间被关在大牢里受了些苦，陈文对于他的忠诚很是赞赏，即便军需司的工作成绩一向没有让陈文不满过，他还是抽出时间来宣慰一番。
几个相关的部门巡查了一遍，还有一些需要改进的东西，陈文打算在彻底考虑清楚其中的利弊后再行改良。此刻已经快到了下值的时辰，最近始终忙得脚不沾地的陈文决定让一向勤勉且经常性加班的周敬亭再加一个班。只是当陈文屏退了大帐内的其他人，与周敬亭把他的计划说明白后，换来的却是一句担忧。
“爵爷，这样做容易招到士林的忌讳，您是不是再考虑一下？”