这一件直接威胁到朱由崧皇位的案件就是太子案了。
弘光元年三月的时候，高梦箕突然把太子朱慈烺在他家的事给供出来！
这太子是从哪里来的？原来内监高起潜的奴仆穆虎，在南下的路上认出了太子，把他带回了家。高起潜又把太子秘密送到杭州的侄子高梦箕家里。
纸是终究包不住火的，高梦萁见秘密已经藏不住，慌忙把太子交了出来。
太子便被送到锦衣卫都督冯可宗家。
朱由崧听到这个消息，立即表态，假如太子是真的，自己绝不食言，一定退位给太子。
于是，一场认太子的戏就上演了。
朱由崧当然不会傻到让大家立即去认，而是在众人认之前，先让内监韩赞周、车天祥前往辨认真伪。两位内监一见到太子，顿时被他的气质所折服，当即跪下行礼，并把皇家的衣服给他换上。
朱由崧听到这样的消息，其震惊可想而知了，又派督营太监卢九德前去辨认太子。
卢九德来这去之前受到朱由崧的指使，要装做倨傲的神情，所以，他一见到太子就高高在上，完全不把他放在眼里。
可是，太子一看到他就直呼其名了！
高傲的卢九德顿时变成卢没德了，慌忙跪在地上！
弘光帝得到这样的消息，自然接受不了，他是一个什么都可以不理的人，唯独影响到他享乐这事，他是坚决不干的！所以他恼怒之下，将内监韩赞周、车天祥秘密处死，又下令把太子关进监牢。之后，认太子的好戏正式上演了。
他遍传朝官识认，朝官们忙冠带朝服前往。
太子南面而坐。
首先出场的是大学士王铎，他指原任讲官方拱干问道：“此何人？”
答曰：“方先生。”
大伙听了顿时愕然，没想到他一下子认出来了。
另一讲官不等别人请他，立即隆重登场，这人就是刘正宗。他仰视着太子道：“认识我不？”
“不识也。”
太子禀承孔老夫子的话，知之为知之，一句不认识让刘正宗很丢脸，但是，在朱由崧看来却是立了大功！
方拱干见姓刘的立功，马上上前问讲读先后。
太子答曰：“忘之。”
其实，别说他忘了，恐怕连方老头他自己也忘了！
方老头一听他忘了，就更加来劲，继续发扬刨根问底的本领，又问书仿字句。
太子依然答曰：“忘之。”
给事中戴英上场了，他问道：“先帝亲审吴昌时于廷东宫立何地？”
这个问题就很难答了，因为崇祯皇帝审判了谁，在哪个地方，他怎么知道？就算他当时真的在场，又怎么记得皇帝站在哪个地方？
太子回答的是：“谁为吴昌时？”
戴英一听他连吴昌时都不认识，立即厉声诘问道：“汝是诈冒！以实告，当救汝！”
太子一看这阵势，就知道情况不妙了，这哪里是来让自己做帝命，分明是来要自己的命！赶紧求救了！
朱由崧见了，便命授纸笔，让他供认假冒之事。
太子只得称道：“高阳人王之明，驸马王昺侄孙。家破，南奔，遇高梦箕家人穆虎，教我冒诈东宫。”