乔和福特顺利找到证物，却在归途中被军人抓捕，押送到核电厂废墟后面隐藏的一个基地。而这个基地则是“帝王计划”的研究场所，致力于研究一个穆托的蛹，并设法困住它。领队芹泽得知乔曾是核电厂的工程师，听闻乔和保安的对话，以及从他身上搜出的资料，发现他和乔怀疑的核电厂事故发生原因竟然相同，是以吸收核辐射为生的怪兽穆托所造成的。
蛹内的穆托，一直以来有与外界期性沟通的迹象，但不知作用为何。然而此时穆托发出的频率越来越频繁，芹泽只好启动电网，意图杀死穆托，然而失败。穆托发动电磁脉冲瘫痪了研究所内的电子设备，乔和福特也趁此机会顺利逃离。但在此时穆托破茧而出，毁坏了大半的研究所，混乱当中乔从高处摔下，送院途中不治身亡。而穆托则朝着太平洋另一端振翅而去。
发现怪兽出没的军方，早已在太平洋周边进行防御部署。芹泽告知军方：以穆托的破坏力，人类的武器无法与之抗衡。恰巧因穆托与外界沟通期间，亦侦测到哥斯拉苏醒的回应，芹泽大胆推断人类需借助哥斯拉的威力来消灭穆托。然而指挥官担心会伤及无辜，表示不予认同。
在父亲身亡后，才了解其所言属实的福特，也担心怪兽会对家人造成伤害，欲向军方贡献己力，借此顺道返回家里。而后军方以监督护卫的方式，跟随哥斯拉经过了遭穆托肆虐的夏威夷而到达本土内华达州；原来亦有一只雌性穆托潜伏在内陆，以赌城附近的核废料场为生，与在日本的雄性穆托经过沟通联络上后，欲在旧金山会合而达到繁殖的目的。哥斯拉则侦测到穆托们的沟通而展开追击，以维持自然界的平衡。
秦天对于哥斯拉也是相当的感兴趣的，不在恐龙之下，面对这样的生物，他觉得也是相当的有价值去研究的，不然也是不可能达到这样的效果的，这些有些他们都明白的事情了。
“我们也是有优势的，不是吗！”秦天看着天网，淡淡的说了起来了。
“如果，我们利用超时代的科技，去解决危险的哥斯拉，也是完全没有问题的，但是哥斯拉的基因，对于什么非常有作用的。”秦天量子天网，淡淡的说道了，面对他们的科技哪怕是哥斯拉也是会有问题的，不然也是他们想不到的情况了。
“我们也是会掌控更多的力量，这个也是我们才保证了。”天网看着秦天，淡淡的说了起来了，也是他们都明白的事情了。
“这些没问题，我想，我们会做的更好的。”秦天看着天网，认真的说道了。
秦天掌控的力量也是越来越强大了，所以也是他们都思考的问题了，一切也是在发展的过程中了，所以也是他们都明白的事情了。
“对于这个情况，我们也是应该明白那些问题的，所以才是我们应该去选择的情况了。”秦天看着天网，淡淡的说了起来了，他也是明白自己应该去做什么的。
虚空神国的问题，只是没有办法去解决，这些也是要靠秦天的办法去解决，所以也是他们都思考才情况了，一切都应该在发展才过程中。