无数机械生物集结的地底深处，银灰色巢座中的少年抱膝蜷缩着。他双眸紧闭，身边管线不停疯狂翻腾，貌似陷入某种异常状态，颇为痛苦的样子。
许久之后，紊乱终于平复，少年缓缓睁开萤绿色眼睛，接收「核心」再度发出讯号的时间和座标，以及眷族们传回的结果。
藉由机械生物眼睛所见，更新过来的失败景象让他冷哼一声，一股波动倏地从他身体发出，一边扭曲景物一边扩散开来，机械生物被击中后，立刻肢体爆裂，哧哧喷发灰色血液，仿佛推骨牌般倒地。
直到波动完全消耗殆尽，方圆百米内，逾千具机械生物破烂不堪，全都停止了机能，当中有几个突然抖动起来，像是强力磁铁般，开始吸附周遭死亡的机械生物，转眼形成一颗颗巨大的球。
收集完所有机骸，大球同时嗡嗡低鸣震动，巢座伸出管线插入球体，开始进行某种改造，使得它们逐渐塌缩下沉。
不知多久后，巨球缩小到约莫两米直径，一半陷落地面中，蓦地啪嗒一声，宛如敲破蛋壳似的裂开。
蜕变完成的机械生物共有六具，全都拥有与主宰极为相似的外型，五官俊秀，体型纤长，不同的是全身被外骨骼般的银灰色装甲包覆，表面布满电路纹样，幽幽发着绿色荧光，看起来颇为诡异。
它们从陷坑走出，步态优雅地迈向巢座，在管线交错的基底前停止，沉静仰望上方的造主。
『去把核心拿来给我。』混沌主宰的声音直接传到六具复制品的脑海。
它们对巢座微微点头，随即转身出发。
◇◇◇
询问完苏菲来历后，联合机构还要调查她与机械生物异常行为的关联，安排了一连串身体检查。
虽然查明了她是混沌发生前制作的碳基义体人类，由于她身体具有不明电磁干扰系统，以亥勃德的技术无法解除，造成其他细节一概无法测量。
这下该怎么处理？
通常遇到无法处理的难题时，都会找常驻机构的渡来者商量，咨询他们建议，然而好巧不巧，渡来者前阵子都被原世界召回，并不在机构内。
管理者将状况如实报告九塔总长，而他们回覆了简单一句话。
继续观察。
联合机构因此软禁了苏菲。
苏菲倒是随遇而安，除了自由受限以及被涅墨亚随身监视，生活待遇老实说还不错，便想趁机在此开启她的新研究。
她也想调查更多自己的事。
首先，在第一个世界线，借用阿勒克托身体醒来的她，如今看来类似硬体里执行的应用程式，属于初始版本，使用终端机连网后，便自动更新了版本。
根据逻辑推理，应该是有人将她的脑机实验资料上传到矩阵网路。
还特地跨越两个时间线，设置了更新档案……
做出这件事情的人，会不会就是消失无踪的阿勒克托？
究竟为什么要这么做？
既然矩阵网路储存了苏菲四年记忆，代表它跟这些谜团有着千丝万缕的关系，或许，答案就藏在里面？
她得连上矩阵网路，搜寻里面的秘密。
但矩阵网路被机械生物占领，随意使用终端机，惟恐又会引发克拉尔兄妹的惨剧……
苏菲决定，先确保能够安全入侵矩阵网路吧。
她寻问管理员能否提供亥勃德人的设备，然后获得这个世界线的通用电脑——跟她习惯的光板很像，相当容易操作。
然而光板与机构主电脑连线，苏菲运算的结果都会同步传给主脑，她并不想给机构知道自己实际在做什么——
于是苏菲将计划的内容拆开，分成许多不同的项目，外人看起来只是普通的演算模型，唯她晓得如何提取关键字串，届时重组起来手动输入到终端机就好。
接着苏菲一头沉浸到研究里，此时的她还不晓得，巨大的危机正在逼近，即将把这个世界弄得天翻地覆。