为了弄清楚真相，美琴透过黑客手段了解到这名少女的资料：长点上机学校三年级学生布束砥信。
同时，为了彻底解开布束砥信谈论关于自己克隆人的传闻，美琴利用调查来的资料半夜潜入樋口制药第七药学研究院。
潜入研究院的美琴，在电脑内发现与自己有关的‘量产能力者实验计划’已被冻结，才放心的离开。
但是，噩梦这个才刚刚开始。
因为，就在她离开之后不久，某位‘妹妹’便出现并将研究资料全部删除。
而‘绝对能力者计划’的户外实验也是正式开了。
在十五号的时候，御坂美琴第一次遇到了在外面执行任务的御坂妹妹，并且亲眼目睹了那个御坂妹妹的重伤。
——虽然那个御坂妹妹，最后被一个不知名的红眸少女给救走了。
于是，发现了实验真相的御坂美琴，便疯狂地对着一方通行发动了攻击。
不过，这一切都没有用。
她的攻击一点也没有起作用，连绝招超电磁炮都被反射了回来。
就在她即将被一方通行所杀的时候，御坂妹妹却是出现了，以实验为警告借口，将一方通行给调走了，救了她一命。
明明是想要救御坂妹妹，但最后却是被御坂妹妹救了，这无疑是让善良的美琴感到痛苦和内疚无比。
尤其是想到前面有那么多的御坂妹妹，因为她的原因而死了，以后可能还会有更多的御坂妹妹会受到伤害，她就不禁是感到痛苦无比。
于是，下定了决心的御坂美琴，开始地大肆破坏与‘绝对能力进化计划’有关联的研究设施，希望能够让计划停下来。
但可惜的是，这无疑是痴人说梦。
而且，在得知有这一层的阻碍之后，实验高层决定雇佣暗部‘道具（item）’来进行防御。
于是，在十九号的时候。
美琴第一次遇到了强烈的狙击，差点就死在了麦野沈利、弗兰达、绢旗最爱、泷壶理后四人的联手之下。
不过，最终，御坂美琴还是战胜了她们。
但可惜的是，实验还在继续进行着。
在昨天回到宿舍与黑子闲聊后，她便下定决心要彻底解决这个噩梦般的实验。
那便是，以自己的死亡为代价，来换取那些科学家们对于‘绝对能力者计划’到底可不可行的思考，以此来让实验有停止的可能。
听着怀中美琴的哭泣着倾述，张翔心中的愤怒和愧疚也是越来越深。
愤怒是对一方通行，还有那些疯狂科学家和亚雷斯塔的愤怒。
而愧疚则是针对美琴的，要是他早一点将这一件事情解决了，甚至就算是告诉她，陪着她一起承担，也不会让她感受到那么得无助和悲伤……
‘不过，这一切，今晚就会停止了……’张翔又再一次抬头，仿佛是透过了那阻挡在自己面前的大楼，看到了数千米之外的实验场地。
“放心吧…这一切今天晚上就会停止的。”张翔轻轻地在美琴的耳边响起着。
“张翔，你想要？”美琴抬起了头，那双哭的通红的眼睛看向张翔的方向。
“放心吧，身为你的男朋友，我会帮你将烦恼给解决掉的。那些伤害你的人，我一定会让他们付出代价的！”张翔的眼中蕴含着坚定。
“不要，张翔，今天晚上我去就好了…对方可是学园都市的排行第一的一方通行，你是打不过他的。而且，只要牺牲我一个人，就可以…呜……”美琴脸色有些苍白地劝说着张翔，打算自己一个人去送死。
不过，她的话语，却是被张翔给打断了。
因为，张翔吻上了她那略显冰冷的嘴唇。
与此同时，张翔的那双猩红的三勾玉写轮眼，也是浮现了出来。
“睡一觉吧，睡一个好觉吧…等到你醒来的时候，一切的噩梦都会过去的……”张翔那温和的声音，在美琴的耳边响起。
而之后，美琴的双眼便缓缓闭起，陷入了睡眠之中了。
随后，张翔便轻轻地将美琴给抱了起来，在他手中握着的苦无符文的闪烁之中。
张翔和美琴同时消失在了小河边，来到了自己新房子美琴前不久住的那一间房间里面。
并且，将她放到了床上，替她盖上了被子。
而之后，张翔便在射进窗户里面的月辉照耀之下，脸上的柔和表情逐渐消失，整个人消失在了一阵空间波荡之中……
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