飞行强化服「is」是唯有女性才能操作的装备，「is学园」则是专门培育is驾驶员的学校，来自世界各国的少女皆以代表候补生的身份进入这所女校就读。然而明明是男人的织斑一夏，却有办法启动is，因而被强制安排到is学园就读。在儿时玩伴箒，以及许多可爱又英勇的女孩围绕下，一夏即将展开他的校园生活！
一夏因故被迫与英国代表候补西西莉亚?奥尔科特对决，争夺班级代表的职务。虽然一夏有箒帮忙特训，但他的实力却一直没有显著提升。直到比赛当天，一夏的专用is「白式」才刚好送达。一夏正式启动这架纯白机体，而西西莉亚则是驾驶鲜豔的蓝色机体「蓝色之泪」应战！这场对决的结果究竟是……。
自从与西西莉亚对战后，周围的女生们对一夏越来越感到兴趣。对此状况感到不爽的箒，还是一样无法坦承面对自己的心情。此时，隔壁班转进来一个中国代表候补生的新同学.凰铃音。以班级代表选手身分来向一夏的班级宣战的铃，原来是一夏的另一个儿时玩伴。据说以前他们曾做过重要的约定……。
班级对抗战的第一回合比赛是一夏vs铃。铃的专用is「甲龙」的破坏力，让一夏陷入苦战。此时，比赛会场内突然闯进一架全身装甲的诡异is，并对一夏与铃发动攻击。虽然两人试图合作击退这架神秘的is……。
一名叫查理斯?迪努亚的金发美少年，以法国代表候补生的身分转学进来。由於他是继一夏之後的第二名男性is驾驶，女同学们也对他颇为好奇。一夏也因为能跟自己处境相同的男生当朋友而感到高兴，经常跟他混在一起。但是，查理斯似乎有某个重大的秘密…。另外，在is的实习课上，属於愈疗系的山田老师也将露出她意外的一面。
白洛辰收集这她们的【is】的资料
身为德国代表候补生的萝拉?博德维希，正式转学到is学园。虽然她外表是个银发美少女，但跟一夏刚见面就赏他巴掌，之後也持续保持这种好战的态度。她如此这麼厌恶一夏的理由是…。另一方面，一夏室友的金发美少年「查理斯?迪努亚」的重大秘密，即将在浴室揭晓！