日军意图以精锐兵力挫败皇军第二联队，但是他们很快就发现诱敌深入这个计策是十分愚蠢的。
并且，明国军队的装备和火力优势是他们难以抗衡的。
经两个时辰激战，第二联队成功击溃日军，桦山久安被当场斩杀，佑笔小亨吉安、枪奉行桦山龙义、兵粮奉行田间次郎等十余名日军将领被杀。
此战，皇军共击毙日军1200余人（含琉球伪军），自身伤亡300余。
得知儿子久安战死消息后，桦山久高竟然十分欣慰，道：“奕奕凛然赴黄泉，武士名留高松苔。”
初战告捷大大鼓舞了皇军官兵，但随后各部却发现日军并没有因为战败而消极避战，反而越发顽强。
发展到后面，在一些险要地带，甚至每一块岩石，皇军都必须经过多次血战才能夺取下来。
激烈的战斗足足持续了四天，皇军的进展不到五十里。
海军方面对陆军的缓慢进展大为不满，一些将领甚至公然指责近卫师团长曹文耀的指挥和战术，这引起了陆、海军军种之间的争执。
“无谓的争吵无助于战场，也无助于减少官兵伤亡，告诉那些指责陆军的海军将领，咱家需要的是团结，是帮助，而不是没有意义的争吵！”
魏公公十分不满海军的表现，因为他老人家已经多次重申海陆两军必须紧张团结如兄弟般。
同时给近卫师团长曹文耀送去手书——“陆军要知耻！”
近卫师团将领们在看到了公公手书后深受刺激，师团长曹文耀紧急召开了一次军前会议，将战前作战计划做了一些调整，改以两个联队攻占日军主力占据的石垣岛。其余诸联队扫荡攻击其余大小诸岛。
“这次进攻由我第一联队打先锋，如果第一联队不能取得师团需要的重大进展，我本人将切腹向师团、向主公谢罪！”
第一联队长真田一郎立下了军令状。
第二联队长陈广睿不甘落后，也起身道：“第二联队官兵不是小娘养的，如果进攻再不顺利，我就提头去见公公！”
知耻而后勇的近卫师团很快就取得了重大突破，经一天激战后，近卫师团以两个联队兵力击溃了占据石垣岛原琉球国府的日军，毙敌2000余。成功解救出尚宁、尚丰王父子。日本僧人菊隐在皇军攻击到他的执政府时上吊自杀。
只是，魏公公满心喜悦的以为攻占了日军指挥中心就意味着战斗即将结束，但他的想法大错特错了，日军困兽之斗反而因此更加疯狂！
桦山久高率余部后退到了石垣岛南端，这是由两座山峰构成的天然屏障，地势崎岖险峻，日军充分利用地形，巧妙隐蔽。
桦山久高决心以此为依托，战至最后一兵一卒，因此日军的抵抗丝毫没有减弱。面对日军更加疯狂的抵抗，皇军则还以更猛烈的进攻。
战至7月24日，日军只剩下千余人，铁枪损失过半，弹药更是所剩无几，但仍是死战不退。
25日，魏公公亲临战场，于日军山峰前骑马检阅攻击队伍，并于阵前将俘虏日军数百人斩首。
“这是最后的一战，没有人可以夺走属于帝国官兵的荣誉，为了皇明，为了陛下，请诸位将你们的敌人统统杀死，毫不留情的杀死！”
“板哉！”
上万官兵齐致高举双手，声震九天。
“进攻！”
随着令旗挥舞、号角声中，皇军官兵们排成一队队手持前端铸有刺刀的火铳向日军冲锋而去。
“阁下，这也是我们最后的一战了。”村山秋安落寞的看着山峰下的红色人海。
26日凌晨，桦山久高在知道明军即将进攻他所在的山头后，脱下了陣羽織铁甲，穿上黒紋付羽織和身边的村山秋安、平田增宗等人一一干杯，喝了最后的诀别酒，然后剖腹自杀。
村山秋安追随桦高剖腹自杀，另有一些武士在知道总大将阁下已经切腹后也选择跟随。
平田增宗没有选择自杀，而是出面召集残存日军放下武器向明军投降。至此，日军有组织的抵抗才告平息，而零星日军的抵抗仍在继续，清剿残余日军的工作一直持续到30日。
八月一号，提督海事太监、大明皇帝亲军监军总太监魏良臣向北京发去捷报，称已尽数歼灭侵略琉球之日军，日酋桦山久高、村山秋安等悉数阵斩。琉球王尚宁现已奉表正式向大明提出内附，从此不为海外藩属，而为大明永久之一府。
“......琉球万国津梁，海贸重要之节点，无论西洋之特产还是东洋之金银，均需从此津梁中转，故此海事重地万不可失与我国，臣特请陛下设琉球镇守一职，以皇军驻防，委官任吏，使琉球彻底王化...”
捷报另外又有密揭，提及日军经营琉球近十年，积蓄宝藏甚多，恐数船难以运尽。如何处置，请皇帝陛下示夺。