施德政有所犹豫，因为名义上他是浙江总兵兼联合舰队司令长官，但具体行动上他是要听命于浙江巡抚高举的，而高举则是要听取以四明相公沈一贯为首的浙党势力。
虽说将在外君命有所不受，可施德政还是不敢轻易附和，这一点就不如沈有容了。侯安之的处境和施德政也是相同，同样受命于福建巡抚黄承玄。之前黄中丞在中左所时就不同意对日本发起进攻，他侯安之又哪里敢冒然支持魏公公呢。
魏公公依旧没有说服成功，虽说有些失望，但老人家也没有就此灰心。他已往北京发出加急密揭，只要银妇能够打动皇爷，一诏密令开战的诏书就是水到渠成的事，到时候不怕施德政他们不干。这会公公只是不断灌输对日军作战的意图，好让施德政、侯安之他们有个思想准备。
是否攻打琉球村山部暂时搁置，公公新得明石道友等倭兵归降，知台湾并无倭寇，因而于二十三日发布大本营二号令，命联合舰队及大明皇帝亲军近卫师团于二十五日自中左所驰往澎湖，再由澎湖登陆台湾。
二号令特别表明，皇军一旦登陆台湾，即于台湾设立皇军都指挥使司，岛上防务及清剿工作交由台湾警备师团负责。
当年沈有容曾率部登陆过台湾，他向朝廷上书请求于台湾设府县治之，未果。因而这次登陆台湾，他特别关心是否将台湾纳入大明版图。魏公公提出的这个皇军都指挥使司是临时设立的军事机构，还是负责军民事务的永备机构。
侯安之也关心占领台湾的日后问题，但和沈有容关心的不在一个点，沈是关心大明从今往后能否永久治理台湾，而不是如从前一样放任自流。侯安之关心的是台湾是否由福建管理。
这个问题对福建方面很重要，福建巡抚黄承玄可是有意将台湾作为闽地贫民移居开垦的宝地的。
黄承玄拟计划向福建迁移数十万闽地沿海百姓，这样一方面能够减轻福建地少人多压力，另一方面则能为闽地百姓获得一块可以生息繁衍的土地。来往台湾的海商和汉民已经确认台湾可以大规模种植水稻，并且还有大量甘蔗，经营得当，台湾的稻米和糖加大大增加福建藩库收入。
所以，如果台湾划归皇军都指挥使司就和福建没什么关系了，那福建方面为此次三省联兵动员军民上万，征调大量钱粮岂不就是打了水漂。
对此，魏公公首先明确告诉施德政和沈有容，台湾以后将永久驻军，永远归大明治理。
其次，写了八个字托侯安之转交黄承玄，八个字是谓——“搁置争议，共同开发”。
好事可能真的多磨，就在联合舰队磨刀霍霍准备登陆台湾时，浙江那边又闹妖蛾子了。
准确的说，村山秋安似乎唯恐魏公公不打他一般，竟然主动配合起来。
就在明石道友这边刚刚归降时，村山秋安派手下倭人桃烟门带三艘战船，倭兵百余人进犯浙江，打破了浙江定海卫的一艘兵船，杀了十几名浙兵。
其后，这股倭兵又流窜至福州长乐沿海，掳掠了二十多人。只是这股倭兵在驶进东沙白犬澳时，因不识水情突然触礁搁浅，无奈只好在此地搭了棚房暂住，想夺取过路船只返回琉球。
浙江定海卫将倭寇入侵的消息报到了杭州，长乐那边也同样将消息报到了福州。结果因为不知这股倭寇底细，消息渐渐走样，最后演变成东南有倭寇万余大举入寇。