不提肖鹏飞融合鲲鹏本体的事，且说当日肖鹏飞被偷袭击落绝仙崖后，三界联军各自返回，回返各自驻地的各方势力，却发现平静的三界骤然形势大变，到处魔物泛滥，凶灵成灾。
就在三界联军与肖鹏飞等人在昆仑之巅对诀之时，天界妖皇、人界妖皇、鬼界妖皇均成就魔帝之身，功力妖法俱皆大成，三者意识合而为一，自称九天妖皇，宣布即日起三界一统，尽归麾下，并以大神通复活百妖门一干妖王，驱使这些妖王率领魔灵大军分别向三界大举进攻，凡人、鬼、仙三界中人，顺者昌，逆者亡，并开始诛除异己。
神州修真界四大宗门被打上门的诸位妖王软硬兼施，欲收为己用时，宣告了当初击杀各派弟子、毁灭宗祠的凶手乃是这所谓的九天妖皇，而并非肖鹏飞，欲以此镇伏各宗就范。
四大宗门这才知道当初果然冤枉了好人，中了妖皇的借刀杀人之计，个个悔不当初，若是肖鹏飞没死，以他的身手，应对这些魔物，实在不在话下，毕竟只有他以前有过独力应对魔灵的经验，并且大获全胜。可是此时肖鹏飞已被击落壁高万仞的绝仙崖，就算他法力再怎么高强，掉落崖下，被禁绝了法术，也是徒叹奈何，只有死路一条。
后悔归后悔，再后悔对当前的局面也没有丝毫的帮助，对于前来招降的妖皇门下，四大宗门拚死抵抗，可是妖皇早就留有后手，配合上次毁灭四大宗门宗祠时潜伏在各大宗门之内的暗棋，里应外合之下，四大宗门被各个击破，各派掌门的元婴皆被魔灵吞噬，最终四大宗门悉数沦陷。