南京城内的巷战持续了三天之久，这让戚虎有点儿惊讶。要知道，古代的战争很少有巷战，一般而言，一旦城门被攻破，一场攻坚战就算结束了，极少有哪位将军会在最后关头动员全城百姓抵抗到底————他们防老百姓都来不及呢。毕竟战争中受害最受的还是老百姓，为了守住城池，守军必须集中全城所有资源，包括城内的青壮和粮食，一仗下来，万户缟素，百姓没有怨气那是不可能的，如果守军纪律差一点，闹出点欺男霸女的破事来，那么，只怕百姓恨守军都多过恨敌人了，在这种情况下谁还敢动员老百姓打巷战？只怕老百姓拿到武器之后首先就把守军给干了吧？但是在南京，明军却真的遭遇了巷战，而且打得还相当惨烈，很多手无寸铁的书生都爬上屋顶朝明军士兵投掷砖石，叛军士兵占据一些坚固的建筑物死战到底，怎么劝都不肯投降，这些家伙总算让明军找到了打仗应有的感觉。而明军也显得格外的冷酷，只要是手里拿着武器的，一律击杀，才不管是秀才还是妇孺，而对那些躲在建筑物内负隅顽抗的叛军，他们直接用榴弹炮轰！他们就是要用血的事实告诉桀骜不驯的江南缙绅集团：时代变了，朝廷再也不会姑息迁就他们这些士大夫了！
三天之后，巷战结束了，南京城内已是尸骨如麻，不知道多少富丽堂皇的底第被榴弹炮生生轰平，不知道多少达官显贵在绝望之中自杀，十里秦淮被鲜血染红，烟花柳巷处处都是悬梁自尽的倒霉蛋，整个南京形同地狱。可即使是这样，攻入城中的明军仍然被南京的繁荣景象惊得目瞪口呆，不少士兵都在嘀咕：“他们这么富裕，为什么非得为了少交一点商税而一步步走到帝国的对立面，最后甚至勾结外敌，险些葬送了整个国家？他们脑子里装的是豆浆么？”
戚虎治军极严，攻下南京后立即着手恢复南京城的秩序，胆敢扰民的将士，不问高低贵贱，一律斩首！同样桀骜不驯的浙军和淮泗军在他面前比孙子还老实，破城之后压轴的烧杀抢掠那是想都不敢想的，不仅不敢动歪心思，还得救治在战争中受伤的老百姓，帮老百姓修缮房屋，忙得团团转。同时戚虎还带一拨人按着朝廷列出来的外单四处抄家，只要是跟这场叛乱有关的缙绅，一个都别想逃掉。每抄一次家，就将抄出来的财物如实公布，刚开始的时候南京百姓还没觉得有什么，但很快他们就被公布出来的那一串串数字所震惊，最后震惊变成了愤怒，人人破口大骂：“好哇，你们这帮道貌岸然的家伙，口口声声说是为了正义天理，汉家道统，其实都是为了钱！为了捞更多钱，为了保住捞到的钱，把我们江南百姓当傻子耍！！！”他们没法不愤怒，看看公布出来的数字，一个九品芝麻官都有数万家财，至于那些世代经营盐铁丝绸的富商就更加惊人了，那数字说出来能把人吓出心脏病！看看这吓死人不偿命的数字，再联想一下江南粮荒的时候这些家伙吝啬到极点的表现，南京乃至整个江南的百姓都有种被玩弄了的感觉，这让他们极其愤怒！
抄家风潮席卷整个江南，只要是跟叛乱有关的缙绅富商，一个都别想跑掉，全家被扔进监狱，家产被抄没。值得一提的是，到底跟叛乱有没有关系可不是他们说了算的，是朝廷说了算，这就直接导致被牵连的人数呈几何状态递增，只怕把所有监狱都腾出来关他们都塞不下了。不过不要紧，朝廷早就为他们准备了一座足够大的监狱，就算他们的人数再翻几番也是塞得下的。
江南叛乱至此大体结束了，小规模的叛乱仍然时有发生，但是已经无关紧要。这场持续数月的平叛之战，明军只投入了不到六万人，轻轻松松就搞定了。战争场面有点儿欠奉，但是这场平叛战争的意义再怎么高估也不会过分：
首先：通过这场战争，朝廷彻底摧毁了桀骜不驯的江南缙绅集团，将这股几乎是从明朝开国以来就明里暗里跟朝廷对着干，到明末更是间接地掌握了整个朝局的政治势力连根拔起，经此一战，曾经辉煌一时的东林党已经不复存在，隆武新政最强大的一股阻力就这样被朝廷以极其粗暴的方式给摧毁了；
其次：平定江南之后，明军通过抄家和查税，从江南挖出金银财宝无数，折合白银超过五亿两之巨，虽说跟清军攻占江南之后掠得白银九亿两的纪录相比还差了一大截，但这已经够夸张了，据说隆武帝在吃饭的时候听到报告，当即就喷了一桌。江南缙绅集团通过逃税和官商勾结，两百多年来积累下来的天文数字的财富现在全便宜了隆武帝，这笔钱为隆武新政的推行打下了坚实的基础，江南缙绅集团也算是为大明的复兴作出了巨大的贡献————只是这种贡献并不是他们乐意的！
南京城被攻陷意味着曾经主宰着大明命运的江南缙绅集团的谢幕，这股强大的势力以一种惨烈的方式退出了历史的舞台，一个旧时代就这样结束了，新的时代随即拉开了弃幕。
就在戚虎忙着抄家的时候，距离南京足有数千里之遥的广州，一支规模相当惊人的船队扬起了船帆，大量人员和物资上船，准备出海了。这支船队的总指挥官依然是姚崇古，这位仁兄因为发现澳洲而声誉跃起，被朝廷封为澳洲大都督。就在大家都以为他已经心满意足，将开开心心地就任澳洲大都督，为自己，也为子孙后代攒一份家当的时候，这家伙却在为一次更加艰苦的远航作着准备，这次他要抵达一片整个亚洲都没有人去过的大陆，在那里插上大明的战旗，而负责带路的，正是西班牙人。
还是在港口，广州商会的成员都过来送他。商会会长拉着他的手，语重心长的说：“老弟，换以前我肯定劝你见好就收的，发现澳洲大陆这份功劳已经够你，够你的子孙吃好几辈子了，太过贪心对你没好处。但是现在……我只能说，把你吃奶的劲都拿出来，我们期待着你能为我们找到一个全新的世界！”
姚崇古拱手说：“放心吧，一定会的！”说到这里，他露出几分神往：“据西夷说，那是一块平坦而辽阔的大平原，气候温暖湿润，有很多河流，降雨充沛，土地肥沃，宜农宜牧，简直如同天堂一般！西夷贪婪无度，只顾着寻找黄金白银，对这等宝地视而不见，这是上天要借西夷之手将这片乐园赠予我汉家子民呀！我豁出这条命不要，也一定要找到那片平原！”