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验货员清点查验货物报数后，统计员则记下货物种类和数量斤两，交给岸上的税务员，他们按照事先准备好的货物分类纳税表噼里啪啦用算盘计算出税额，然后船主交税领取证明完税的册子，首次来的还要领面“琼”字旗子插在船上，纳税的流程就算走完了。船主们把这个流程称之为“过关”。
博辅税关开张后，第一个月就收入二十万两白银，几乎是棉布生意一年的销售额。从第二个月起，“过关”的商船密度下降，收入减少，但是还保持了平均十二万两白银的月平均收入。考虑到部分海商还在观望阶段，加上巴达维亚等地的欧洲商船还没等到返回欧洲最佳的风向，这个数字还有上扬的空间。
台南税关也同步投入运作，不过纳税的情况没有博辅这边乐观。第一个月只有十万两的税收，第二个月更是降到了八万。据郑鸿逵估算，至少有四到五成的海商抱着侥幸心理没有来台南，而是径直前往日本，尤其以江浙一带的海商居多。恰恰是这些海商掌握了江南大部分生丝和丝绸的出口，是台南税关最主要的收入来源。以日本和南洋的贸易利润对比，台南税关的收入应该是博辅税关的两倍才算正常。
林传宗作为台南分舰队指挥官，已经开始了福建海峡和东海一带的巡航，但是受限于巡逻舰的数量，加上台南新建的船厂还没有投入使用，兵力上捉襟见肘，巡航效果还不甚明显。
这个时候，在长崎的刘全回来了，他带来了几个消息，有好的，也有坏的。
南园。
刘全向夏天南禀报：“首先要禀报将军，长崎商馆成立了，肥前藩给了我们最繁华的地段，离港口也近。将军战胜郑芝龙的消息传来后，肥前藩的人更是鞍前马后服务极其周到。商馆的馆舍已经建好，人手也招募了，不过管事的人选还没定，属下这次回来，想选派一个机灵点的人过去。”
夏天南满意地点头：“你辛苦了，管事的人选就由你决定。商馆运作后，我们就把江南出口日本的生丝作为长期的买卖经营，就算不能垄断苏州、杭州两地的生丝市场，也要尽量压制当地海商的利润空间，免得让这些人赚了银子还逃我们的税，收不到他们的税咱们就自己赚回来！”
刘全在日本几个月，对税关的事不太了解，闻言惊讶道：“逃税又是怎么回事？”
夏天南就简单解释了台南税关税收流失严重的情况。
刘全听完拍了拍脑袋：“这个好办啊！江南的生丝大半都是卖到日本，只有丝绸成品才运往南洋。日本的幕府又颁布了锁国令，明朝的商船只能在长崎交易，咱们只要堵在长崎港口对本朝的商船挨个盘查，谁交税谁逃税不就一清二楚？”