在宇宙的衰亡期，创始元灵的能力在不断被削弱，到了后来，星系间的群星越来越近，每天都有许多颗太阳和行星被吞没在黑洞当中，或者莫名其妙地消失了，有时则是超新星爆发。
创始元灵阻止不了这一切的发生，他满腔忧伤地看着一个又一个住满了供奉自己的信徒的星球消失在虚空中，或者被越来越强大的黑洞吞没。
人口在迅速减少，曾经的史上最庞大帝国正在衰弱，靠近庞大星系中部的那些居民首先出现了智力下降的征兆，许多年青人在变笨，不断变笨，忘记了如何驾驭飞车，忘记了如何编写程序，对于高等数学两眼一抹黑，曾经掌握的知识正飞速地被遗忘。
创始元灵的能力在变弱，当然，他仍然是数万个宇宙里以及许多个维度上最强大的神，他固然在变弱，但是别的神被削弱得更厉害，许多曾经不可一世的神都莫名其妙地消亡了。
在末日接近之际，人们想尽一切办法想要逃生，他们进入飞船，飞向茫茫的黑暗空间，想要远离庞大星系，逃离吞噬一切的黑洞，但是这样的努力没有任何效果，这些驾驭飞船逃离的人们智力在不断下降，莫名其妙地下降，谁都无法解释这种事，飞船的速度也在下降，在几代人之后，居住在飞船上的人已经不知道如何操纵飞船，智商下降到了略高于猴子的程度，连最基本的几百个字都不认识了，语言退化到只剩下几百个简单的章节，甚至都不能称之为词汇，而在这个时候，逃生的飞船就算幸运地没有被虚空吞没，速度也下降到不足十分之一光速，逃生成为了完全不可能实现的事，最终，这些飞船噩运难逃，被吸入到越来越强大的黑洞当中。
曾经像一处大乐园的庞大星系塌缩到只剩下几千万颗太阳以及围绕这些太阳转动的行星，但是这些残存的太阳距离核心的巨大黑洞越来越近，可以肯定，在几万年之内，这些太阳都会被吞噬，一个都无法剩下。
创始元灵曾经尝试过把某一颗被选中的太阳及其周边行星移动到远离大星系的空旷星空当中去，但是结果很不好，这样的太阳系往往会莫名其妙地消失了，甚至都搞不清楚去了哪里，经过十九次尝试之后，他放弃了这样的行动，因为没有效果，被弄得远离大星系中心黑洞的太阳没有一颗存活下来，全都在千年当中消失了，而到了后期，他由于能力不断下降而不再具有移动太阳的能力。
为期十一亿年的大毁灭过程当中，创始元灵及其朋友和徒弟想尽了一切方法，创造出各种各样的结界，各种各样的封闭空间，但是均不能保护信徒，同样的事不仅仅只是发生在这个宇宙里，也发生在别的宇宙和维度当中，毁灭是共同的，谁都无法置身事外。
所有的物质只有两种结局，一是被吸入大星系中心的巨型黑洞内，或者就是莫名其妙地被虚空吞噬，据一些科学家在几亿年之前曾经很确定的理论研究说，那是这个宇宙和反宇宙相遇之后会发生的事。
曾经浩瀚的空间如今充满了不可知的陷阱，而是大星系内部，中心的巨型黑洞仿佛永远不知道满足，什么都会被吞噬进去，没有什么可以剩下。
最终，天空中星辰消失殆尽，只剩下无边无际的黑暗。
这时候创始元灵仍然活着，只是变弱了许多，智力下降得很厉害，许多记忆丢失了，许多事再也无法想起来，他和朋友以及徒弟情况同样糟糕，无一例外身体都没了，消失无踪，这些幸存的神只剩下元神，躯壳莫名其妙地就不知去向。
宇宙消亡了，成为几百万个质量超大的黑洞，接下来是漫长的黑暗时代，为期十三亿年，这段时间里几百万个质量超大的黑洞合并成为几万个，他和朋友以及徒弟过着乏味而无聊的生活，他们在这时候的存在显得很奇妙，身体没了，而元神仍然靠强大的神力而继续独立存在，正是由于他们超强大的修为，才得已存在下来，而别的那些神则全部没有了，消失了，死亡了。
漫长的岁月里，他们又遗忘了许多的事，同时又想出一些新的事，由于时间太多，他们有许多的时间来思索和规划未来，他们一致决定，等未来一切重新开始之后，一定要创造出一个更美好的宇宙，要培育出更多能够度过宇宙毁灭的同伴，那样的话，未来才可以更热闹，至少不像现在这么无聊。
他们策划着创造一个永远不会毁灭的宇宙，或者永远恒定的宇宙，他们知道这个愿望不大可能实现，但是他们都在期待更好的未来，憧憬着在将来可以变得更强大，更优秀，把一些如今只能想象的事变成现实。
漫长的黑暗时期内，时间流逝的速度是不太正常的，远远比正常的更快，虽然是十三亿年，但是在这伙幸存下来的神的意识当中可能只相当于七千万年，当然这也是超漫长的一段岁月。
终于，盘古大神想到了一种方法，可以提前开启新的宇宙时代，在创始元灵和其它的神帮助，盘古将设想付诸实践。
盘古以不可思议的奇异神力引爆了一枚质量大到近乎无限的黑洞，几乎就在同时，黑暗虚空当中的几万只残存的黑洞仿佛有某种默契般同时爆炸了，近乎无限多的物质被抛出来。
时隔十三亿年，宇宙中再次出现了光明。