同济会的行动轰轰烈烈地展开着，挟着战胜之威，顺着倭寇覆灭的大势，同济会的扩张大有不可阻挡的威势。
而与此同时在马六甲的刘赐早已走出了战胜的喜悦，实际上在收到弗朗机人总督签署的协议书的第二天，刘赐就已经开始着手进一步稳定巨港的权力结构，他明确将驻守巨港的刘家军整编为同济会的直属军队，也就是说整支巨港的刘家军仍属同济会直接管控，并且刘赐任命于潜为巨港的第一守将，巨港的军务交由于潜负责。
于潜从十年前刘家军草创时就加入刘家军，他出身自南直隶官军，这些年经过征战和诸多的考验已经证明了他的人格和忠诚，所以刘赐对他有着充分的信任，于潜认同同济会关于“大明的未来在大洋”的理想，所以他愿意为了这个理想而奋斗，他能够保证同济会在马六甲的力量忠诚于同济会的大本营。
而刘赐明确了马六甲的军队是同济会的直属军队，这也明确了林道乾为首的那支收编进刘家军的倭寇军队成了“雇佣军”一般的存在，林道乾的军队不是同济会的内属军队，但是同济会会给他们充足的银钱，雇佣他们为同济会作战，如若他们证明了他们的忠诚，那么同济会可以将他们收入编制内，成为正式的“刘家军”，而他们如若缺乏忠诚，甚至企图干些祸乱之事，那么巨港的武装力量里面刘家军的力量仍然占据优势，能够有效地压制他们。
通过调整权力结构和编制结构，刘赐稳定了巨港的军心，他自己则逐渐脱离了战事指挥的任务，将军务逐渐移交给了于潜，这个交接是很顺畅的，巨港的军务和防务在于潜的领导下迅速地继续运转起来。
而在同济会在马六甲取胜之后的一个月间，已经有大大小小的十几股倭寇团伙前来马六甲投靠，这些倭寇团伙自然都是被戚继光和俞大猷打散的团伙，他们在大明的海疆已经无法生存，和林道乾一样，他们流落到了交趾、暹罗一带，而听说同济会在马六甲的事迹，他们纷纷渡过重洋来到马六甲投诚。