对印度尼西亚马来西亚和菲律宾的战争，在苏浩离开四个月后全面启动。三个远征军团分别由唐姿杜天豪和梁钰率领，从金兰湾海军基地出发，在各自指定地点登陆。跨海攻击战前后持续了五年，王启年的潜艇部队给予了最大程度的后勤保障。战斗方式仍然还是在当地建立基地市，以此作为依托，对周边地区清剿扫荡的办法。除了数百名被认为有价值的学者被转化为“工蜂”，对当地民众进行血统甄别之后，被排除的目标全部被杀死。
那段时间，僎他群岛附近的海域到处都是浮尸。密密麻麻的尸体几乎布满了数十平方公里内整个海面。大量海鸟纷纷距离过来以腐尸为食，鲨鱼之类的食腐动物数量急剧增加。由于死尸数量太多，海域污染程度剧增，很多尸体被扔进大海后，又被海浪推到岸边。到处都是螃蟹和弹涂鱼，很多虾类也蹦跳着在浅水中觅食。
把尸体扔进大海的做法，是杜天豪首先干出来的。越过马六甲海峡在杜迈登陆的时候，他就携带了大量工程机械。短短两天时间，他已经扫清了北干巴鲁附近的所有障碍，同时把所有俘虏押往海边集体屠杀，再动用推土机之类的工程机械，把所有尸体全部推进海里。
海浪是个令人头疼的麻烦。杜天豪的解决方法很直接。他强迫俘虏沿着海边砌了一条两米左右的墙，算不上结实，却可以挡住被潮水推上来的尸体。杜天豪认为自己是在为后代子孙造福：周边渔场大都捕捞过度，很多经济鱼类几乎绝种。有了这批数量庞大的尸体为食，几年以后，这片海域又将回到过去繁盛的时代。
对变异生物的猎杀清剿，进展速度要比屠杀当地平民慢得多。无论物种进化程度还是基本外形，这里的怪物都与国内差别不大。最多只是因为被感染者皮肤和外观上的差异，整体颜色看起来较黑，体量也相对偏小。即便是在苏浩原先的时空，变异生物仍然不是五阶强化人的对手。面对武装到牙齿，全员战斗力均为五阶强化体质的“工蜂”，当然只有死路一条。
梁钰和唐姿很快套用了杜天豪的方法，把所有被杀的当地平民扔进大海。很不巧，一架隶属于澳大利亚军方，配属在卑斯麦群岛上的侦察机飞临这片海域。机组乘员当即被海面上多达几十万的密集尸群所震惊。他们立刻向总部传送了当时拍摄下的恐怖画面，远征军的所作所为也由此被外界得知。
大屠杀造成的影响显而易见，直到今天，王启年仍然认为：正是因为当时各个远征军团在东南亚和其它地区肆无忌惮的大规模杀戮，这才导致盘踞在废弃城市里的变异生物出现了退化。生物进化必须以种群延续为前提，丰富的食物来源有助于生物数量增加，也是强大的根本。远征军把变异生物和当地居民都列为敌人，大规模屠杀居民，使变异生物无法获得食物，废弃城市被接二连三攻破，也不断缩减生物种群。在这种情况下，它们只能被迫再次变异，把原本用于强化牙齿爪子等捕猎及战斗工具的生物力量，转化到腿部肌肉皮肤，乃至生殖系统等方面。
只有肌肉强壮腿脚够长才能跑得快。
只有强化生殖系统才能生下更多个体，延续种群。当然，肯定有很多变异生物会在幼生期死去，也有很多成年个体被活活饿死。但只要数量够多，就有一部分可以幸存。鱼类就是最好的例子：它们往往一次分娩多达万计的受精卵，大部分卵粒成为其它物种的食物，即便成功孵化为小鱼，仍然摆脱不了被大鱼吃掉的命运。但不管怎么样，总有很少的小鱼成年，重复着父母亲族痛苦的繁衍过程。
苏浩原先的时空没有远征军存在。以越南为例，苏浩离开的时候，当时的越南总理是阮文明，也是国防军总司令。那支军队数量多达三十万，在老挝和柬埔寨干着与远征军同样的事情。只是由于联合国与国内军部的干涉，被杀死的平民数量远远不及现在那么多。
东南亚地区发生的事情，很快上报给了联合国总部。美国方面在第一时间派出联合调查小组，同时以极其严厉的措辞，要求中国方面立刻停止在该地区的一切军事行动。在当天召开的大会上，几乎所有国家都对这起事件表示出强烈愤慨。日本政府当即提出特别议案，要求对中国进行联合制裁，并以战争罪和反人类等多项罪名起诉中方，要求国际法庭予以应允。
听到这个消息的时候，王启年只是撇了撇嘴，什么也没说。
如果是在和平时期，这肯定是了不得的大事。然而现在，谁还会把“制裁”之类的东西当回事？所有国家连自己领土上的变异生物都无法解决，哪里还有额外的力量发动战争？何况，在所有核心国家里，中国的强化药剂产量是最多的。
美国人派出了二十多人的调查小组，飞机于当天在麻拉鲁皮附近被命名为“海州”的基地市降落。杜天豪很不客气的把这些不请自到的客人全部抓起来。面对调查人员的抗议和咆哮，他只是打开电子屏幕，按照对方提供的频道连接远程通讯。当屏幕上出现满面威严，义正言辞美国首脑的时候，他直接把所有调查组人员按照性别分开。男的扔进捕捉到的变异生物笼子里喂食，女的则扔给关押在基地外面的数千名印尼平民。那些俘虏最迟第二天上午就会被集体屠杀，在临死之前，能够得到几个美国女人凌辱一番，倒也算得上是最后的优待。
血腥残暴的画面震惊了在场的每一个人。美国方面的官员冲着杜天豪咆哮指责威胁，最后变成了恳求与哀告。这一切没有得到丝毫效果，杜天豪冷硬着心肠，默默注视着那些人被变异生物撕裂，被无数红着眼睛的男人吞没……直到最后，当屏幕上的美国官员用颤抖声音问他“你究竟是不是人？你难道不知道所有人类都是同盟，都在集体对抗变异生物”的时候，杜天豪终于做出了回答。
“我当然是人类，我也知道现在是生物战争时期。不过，有一个问题需要更正。我首先是一个中国人，然后才是人类。”
美国人的反应速度很快，关于印尼群岛发生的大屠杀，以及杜天豪的回复，很快在全世界所有通讯频道开始传播。军部不堪压力，宣布撤销西南战区所有部队番号，505集团军为反叛部队。在昂长的反叛人员名单上，集团军司令官高立权赫然列在首位。
就在这一天，联合国大会通过决议：原中国方面505集团军为恐怖组织。
鉴于东南亚地区事态正在失去控制，美国与英国以海军残余人员组成联合救援部队，配属两艘航空母舰和其它数十艘舰只，前往新几内亚岛，全面封锁远征军的后勤补给。
这支舰队几乎没有任何战斗力。即便是构成舰队核心的“福特”“里根”两艘母舰，舰上人员也只有区区数百名。他们只能维持舰船最基本的航行与观测，虽然配备了二十多架飞机，却被命令只能对水面目标进行攻击，严禁接近陆地，更谈不上什么登陆作战。