“起锚！”
厦门港口，随着急促的铜锣声，一艘艘战船上的旗手立时打出了旗号。士兵们七手八脚的将铁锚从海中捞起，然后升起风帆，井然有序的驶离港口向着北方驶去。他们将先到抵达舟山，和那里的东海水师主力会合后再一起奔赴崇明。
为了统合水师，周士相刚刚颁布水师调令，长江水师和东海水师合称大明水师。
原东海水师郑鸣俊、郑缵绪部分为第一舰队、第二舰队；原刘国轩部水师为第三舰队；原杨英部水师为第四舰队，统领为萧拱辰，杨英为副；原长江水师则为第五舰队，舰队统领是原浙军总兵郭法广。除此之外，又委陈永华为第六舰队统领，留守金厦。原隶广东指挥的远征军水师和广东水师编制暂不动，仍归广东总督衙门提调指挥。
整合后的大明水师一共拥有大小战船近千艘，大小火炮三千余门，水兵三万余人。其中大战船共有142艘，火龙熕船26艘。
按照军部制定的计划，金厦这边除留下第六舰队的130艘战船归甘辉统领，以应对有可能出现的红毛鬼入侵，其余战船尽数北上，参于辽东大战。各舰队将在长江口的崇明会师，届时周士相也将自那里登船。除却在金厦装备的钱粮物辎外，沿途在舟山、崇明等地，也将陆续停船装运物资。
“封土令”在六天前就传达到了最底层，以各种方式告谕士兵和民夫，沿海各港口也都布满招兵北上榜文，上面无一不是以“封土”来吸引普通渔民参军。
可以在辽东当“领主”，成为比乡长、知县甚至知府还要高一等存在的诱人政策，令得沿海不少渔民铤而走险，报名参军北上，结果竟使得一些地方打鱼的船都不出海了。
水师方面士气高昂，陆师方面同样也被调动起热情。考虑到水师要在海上航行两个月才能到达辽东，故周士相命令将从前有过海上转运作战的部队优先调入北上作战部队，这样能够使参战部队尽快适应海上生活，同时军中有足够的老兵能够教导那些没有上过海船的新兵如何在海上生存。
周士相同时以三镇为基础，建辽东野战军团。
新组建的辽东野战军团主力为苏纳的第六镇；以原郑袭部下陆师精锐改编而成的第十六镇，镇将甘辉；以原浙江绿营和从太平军第七镇、第九镇分别抽调有过海战经验的营卫组建而成的第十七镇，镇将为第七镇的副将，甲旅旅校韩朝宗。
如何将三万多陆师连同火炮辎重一次性运到北方的辽东，原本是军部发愁的一个大难题，但当周士相将这个计划告诉水师那帮将领后，这些将领却轻松的告诉齐王殿下，休说三万多将士，就是十万将士，他们也能轻轻松松的一次将人运去。
显然，此前军部的参谋们也好，周士相也好，都忘记了去年郑军大举北上时出色的组织和运输能力。可以说，郑军水师的归降不单让周士相对满清灭族的战略决定变得可行，同样也为太平军带来了从前没有过的各种经验。这些经验都是十分宝贵的，比如周士相在广东曾干过一次的海上跳跃登陆作战，在郑军这里却是实施过很多次的，可谓经验十分丰富。这就省却了许多时间，也省却了许多麻烦。
苏纳的第六镇直接就在金厦港登船，甘辉的第十六镇和韩朝宗的第十七镇却被组织进行一次长途拉练，行程从金厦至松江。之所以如此安排，主要是这两个镇都是新整编，指挥系统和上下级关系都在磨合当中，将来到了辽东后是要大用的，所以在没有时间进行一次军事演练的前提下，组织长途拉练无疑是种很好的锻炼办法。