因为朱由检知道这些军镇肯定都靠不住，所以就没让他们承担抵御建奴的主要力量。
毕竟这些军镇现在都肯定想要自存实力。
要不然历史上也不会大部分都降清。
朱由检甚至还不得不将近卫军安置到一些重要地域，防范这些军镇军阀，不但不替自己抵御建奴，反而会南下要攻打自己。
所以，朱由检在接下来在整编近卫军现已训练完成的三万战兵时，就安排了这三万战兵不同的驻扎位置与军事任务。
“传旨，令以近卫军原第一野战步兵营为骨干扩编出近卫军第一镇，由参将刘肇基、总训导官（相当于后世政委）秦荣真节制，驻守沐阳，守淮安府北部区域，防止刘泽清部与建奴经山东南下！”
“以近卫军原第二野战步兵营为骨干扩编出近卫军第二镇，由参将赖继光、总训导官代腾节制，驻守山阳，守淮安西部区域与维持淮安府城周边稳定，防止占有徐州、泗州的高杰部进占淮安！”
“以近卫军原第三野战步兵营为骨干扩编出近卫军第三镇，由参将刘恺希、总训导官陈元节制，驻守清河，守漕运渡口，并防止寿阳刘良佐与睢州许定国等进占淮安！”
按照近卫军的最新编制。
营上面设镇。
每镇辖三个营。
而近卫军一个战兵营的战时满员是四千余人。
所以一个镇辖有官兵一万多。
但骑兵战兵是例外。
因为骑兵训练成本高，光是骑射都要训练两年以上才能成为一名合格的骑兵。
所以，现在的近卫军骑兵数量还不多。
周遇吉当初从宁武关带进京城的六千兵马中，骑兵也不过只一千骑。
即便招募到一些天生会骑马的北方士卒加上半个月的训练，如今也才凑足不过三千多骑兵。
而朱由检还是想壮大骑兵队伍的。
毕竟在坦克出现以前，陆军中机动性最强的还是骑兵。
所以，朱由检也就除了把抽调一千余周遇吉以前从宁武关带来的骑兵补进各镇担任哨探和通讯任务外，依旧把剩下两千骑兵独立编成了一个近卫军第一骑兵镇，由原京营都督同知新宁伯谭弘节制，担任该镇参将兼总训导官。
“以后设立五军都督府大都督一职，由朕亲自担任大都督，节制天下兵马，主要是近卫军，五军都督府总领军事，周遇吉担任五军都督府大都督同知兼近卫军总兵官，张凤翔担任五军都督府大都督佥事。”
站在朱由检身后的周遇吉等将领皆因此拱手回道：“遵旨！”
“以后内阁总领内政，大都督府负责军事。”
朱由检接着又对蒋德璟说了一句。
蒋德璟回了一句：“臣明白！”
如此一来，朱由检的大明中央机构就正式实行军政分立的政治模式，五军都督府管兵政，内阁管民政，而中央处就相当于军机处，为皇帝朱由检的秘书机构。
而也因此，朱由检对于应对建奴南下的所有措施基本已经安排完毕。
但有时候统治一个帝国是真的没那么简单，尽管朱由检安排了好所有针对外敌建奴的策略，但他的内部也依旧还有许多的麻烦，需要他拿出办法去应对。
这时候，蒋德璟就拿出一封奏疏来：“陛下，南京兵部尚书史可法和吏科都给事中窦顶等联名上奏，请陛下裁撤皇庄，并严查厂卫，以清冒家被屠之冤。”
史可法是东林党。
这个朱由检是知道的。
但朱由检也知道史可法在历史还算是一位忠臣，最后殉节而死。
不过，能臣就算不上了。
因为据朱由检所知，史可法在历史上守城高墙厚的扬州城仅守了不到一日就扬州城破。
所以，朱由检有理由认为史可法算是一有忠心但没能力的官员。
而在这时候，蒋德璟在念完奏疏后，说道：“陛下，这已经是第五本南京官员上疏要求查厂卫且为冒家鸣不平的奏疏了，这次还留中不发吗？”
朱由检不由得哼了一声：“这些留在南京的官员真是够可以的，都这个时候了，还抓着这个不放！继续留中不发，当初他们劝阻朕去南京的事，朕还没跟他们算账呢。如今竟敢还没完没了地干扰朝廷的大政，等打退了建奴，朕再好好收拾收拾他们！”