不过，相比藤条抽死的，蟒蛇缠死的，更为麻烦的还是蚊子。热带雨林里的蚊子能传播各种各样的致命的疾病。最为要命无非就是疟疾和黄热病了。
对此，史高治也是知道一些的，为了避免不必要的损失，他也是准备了一些措施的。比如说在他的指示下，麦克唐纳化学和医药公司研制了一种药水，据说喷在身上，就能保证至少两个小时之内没有蚊子咬。不过，这个药水并没有给工人们用上。甚至史高治也根本就没打算让工人们用这个。另外，有机磷农药什么的也不是特别困难的玩意儿，真的要造，分分钟造个几万吨出来，保证可以让运河区所有的野生动物全部绝种。只是这东西史高治也没打算用。理由嘛，真是太简单了：难道你觉得现在真的是让运河修好的好时机吗？
在史高治得手里还有一条太平洋铁路，这条铁路眼看就要贯通了。如果这个时候，运河通了，那你让那条铁路怎么赚钱？先前史高治轰轰烈烈的搞了一大通子，为了这条运河，甚至把哥伦比亚都搞分裂了，于是史高治真的没有花太多的钱（好多钱还是其他投资者的钱，并不是史高治的，亏了也不心疼），就让全世界都相信，他是真的打算挖运河了。
受这个消息的影响，尤其是大批的工人开始开挖的消息的影响，太平洋铁路的股价掉了不少，嗯借这个机会，史高治又将原本不太在他的控制下的中央太平洋铁路的股分低成本的买进来了不少。相信将来等到运河开发失败的消息传出来之后，能让史高治赚到不少的钱。
更何况，在操纵巴拿马独立的时候，造成了南美洲的军备竞赛，如今原本因为内战结束而生意下降了的麦克唐纳步兵武器公司立刻又赚的盆满钵满的。同时，通过雇佣费，黑水都赚了不少钱——虽然建立黑水的时候，史高治就没打算靠它来赚钱。除去那些做假的投资，赚回来的已经多得多了。而如今，巴拿马欠了史高治一屁股的债，到时候，突然运河建不成了，那个还债压力，绝对能让历届巴拿马政府老实听话，将来真要再建的时候，也能再狠狠地压一次价格。
史高治已经想好了，等着这一批日本工人开始因为疟疾呀，黄热病呀什么的东西，呼呼呼的死人的时候，就装出一副用尽了一切办法，依旧无法控制局面的架势。然后在一口气死了上万人之后，就出来对社会忏悔自己的骄傲，说自己被以前的成功冲昏了头脑，自以为能够战胜一切的传染疾病，犯下了骄傲的大罪。让后公开向大自然认输，并表示，在没有能力解决这些乱七八糟的热带传染病之前，出于人道主义的考虑，他决定放弃这个工程。并建议后人，在没有解决热带病的方案之前，不要试图开挖运河。
这样看起来像是下罪己诏，但实际上的效果却绝对是在自我表扬。你看，在这个为了金钱，往往会无视工人生命的时代里，如果换了别人，为了赚钱，才不会在乎工人的死活呢。更何况死的还只是疑似人类的日本人，谁会在乎？甚至于，恐怕日本幕府自己都不会太在乎。说不定，他们还会因为少了卖人赚钱的门路而惋惜呢。只有我们的史高治，一贯是个有良心的资本家，从来都是把人道主义，人文精神放在赚钱前面（做幌子）的。才会做出这样的有良心的选择，宁可亏本，也要保护生命。这是多么伟大的精神呀！
当然，在于病菌的战争中屡建奇功的，开创了人类战胜传染性疾病的新纪元的史高治都没法对付这些热带传染病，都不得不在它面前后退，今后还有谁敢去乱开这条运河？如果没有史高治前面的表演。那么无非就是多死点工人，反正工人不值钱，死他个几万十几万，绝对能解决问题。但是在史高治高逼格的表演之后，任何人还敢这样做，那就完全不是人了，那就会被全世界富有正义感的人所唾弃，那就会，嗯，走上斯坦福先生的老路，反正，就是肯定会被全世界热爱人类，坚持正义的力量打倒在地，再踏上一万只脚，永世不得翻身。
所以，这样一来，这条运河到底什么时候开发，主动权就真的全在史高治手上了，到了必要的需要真正开发的时候，史高治宣称，他已经取得了技术上的突破，能够对付这样的疾病了，然后各种驱蚊药水还有有机磷农药稀里哗啦的一用，运河自然就贯通了。于是人类战胜传染病的历史上，就又会留下浓墨重彩的一笔。而史高治这样一个从哪里跌倒，又从哪里爬起来，百折不挠的坚持战斗，最终为人类战胜病魔做出了不可磨灭的伟大贡献的光辉形象自然就越发的让人敬仰了。许多年后，人们在谈起巴拿马运河的开凿的时候，死掉的数以万计的日本工人就会变成衬托史高治的人道主义和科学精神的鲜红的油彩。
在一个星期后，第一个染上了黄热病的案例出现了。不过，依据剧本，这个时候还是属于由于骄傲而疏忽了的时候。于是医生们给他用了一颗海洛因，压制了一下症状就把它不当一回事的放过了。
一天之后，更多的病例开始出现了。当然，这个时候的办法还是，先吃一颗磺胺（这个毫无作用），再来一颗海洛因（掩盖症状）。于是，一切都很正常，所有的病人都感到很舒服，什么问题都没有了。只是到了这天晚上，突然刮起了大风，下起了暴雨。在漆黑的黑夜中，在无边的暴雨中，工人营地里的日本工人似乎听到外面那茫茫的丛林里传来了一种怪异的，凄楚的叫声。这叫声在暴雨声中时高时低，若无若有，听得让人毛骨耸然。这也许是雨林的精灵在呼号，它在警告：“大瘟疫，大瘟疫就要来了！”只是安安稳稳的睡在远在千里之外的鸭堡的柔软的床上，身上盖着鹅绒杯子，怀里还抱着多萝西娅那赤裸的娇躯的史高治是听不到这个声音的。当然，如果让他听到了，说不定这个毫无节操的家伙还会补上一句：“让大瘟疫来得更猛烈些吧！”